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R软件基础知识与实战.doc

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R 软件基础知识与实战第一课:基本知识第二课:基本运算第三课:画图第四课:数据整理和数据分析第五课:统计分析第六课:分布的产生第七课:求导和极值的计算第八课:Bootstrap 方法第九课:MCMC 算法第一课 基本知识一.R 的历史与特点Object-oriented 语言二.R 系统介绍安装镜像Installing packages library(survival) # 加载程序包library(help=survival) # 显示程序包 survival 里的内容help(mean) #查看关于函数 mean 的帮助search() # 给出系统里已加载的程序包searchpaths() # 给出系统里已加载的程序包的路径Commands are separated either by semicolon or a new line三.Data objects# There are 7 basic types of data objects:# Vector, Matrix, Array, List, Factor, Time series, Data frame# creating vectors# vector type: character, numeric, integer, logical, complexmy1 5/0Inf 0/0NaN # not a number a = c(1,2,3,NA,4) # NA represents missing value mean(a)[1] NAa = c(“asia“,“da“,NA) # NA 也可以代表字符型的 missing valuea = c(T,F,T,T, NA)# NULL 代表一个空值a = NULL # a is a empty vectorfor( i in 1: 10) a[i] = i^2# testing and coercingletter = factor (letters) is.vector(letter) # test whether letter is a vector[1] FALSE letter = as.vector(letter) # coerce letter into a vectoris.matrix()as.matrix()is.data.frame()as.data.frame()is.list()as.list()………write.table(lizard, “E:/R/new.Rdata“)new = read.table(“E:/R/new.Rdata“)save(a,lizard,new x, file=“E:/R/mydump.rda“)load(file=“E:/R/mydump.rda“)sink(“E:/R/new22.txt“) lizard ls() sink()四.Data manipulation逻辑运算符号符号 意义= = 等于!= 不等于= 大于等于 大于= 30 # 一个逻辑值向量myseq[myseq =30] # 给出 myseq 里大于等于 30 的所有值 x 2]x[ x 2 else sigma - 0sigma }smry - function(X){ mu - mean(X); sigma - stdv(X); c(mu=mu,sigma=sigma)}patients - c(“0071021198307012008001400400150“,“0071201198307213009002000500200“,“0090903198306611007013700300000“,“0050705198307414008201300900000“,“0050115198208018009601402001500“,“0050618198207017008401400800400“,“0050703198306414008401400800200“)id - substr(patients,1,3); date - as.Date(substr(patients,4,11), format = “%m%d%Y“)hr - as.numeric(substr(patients,12,14)); sbp - as.numeric(subst
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