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细菌的分类及命名.ppt

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细菌的分类及命名,一、 细菌的分类地位 二、 细菌的命名 三、 细菌分类鉴定的标准 四、 细菌的分类体系 五、 细菌的鉴定,一、细菌分类学——对细菌进行分类,命名与鉴定的 一门学科。,任务:,在全面了解细菌生物学特征的基础上,研究它们的种类,探索其起源,演化以及与其他类群之间的亲缘关系,进而提出能反映自然发展的分类系统,并将细菌加以分门别类。,细菌分类学包括分类,命名和鉴定,1、细菌分类:根据细菌各自的特征,并按照亲缘关系分类,以不同等级编排系统。分类有两种:①细菌的生理生化分类法,包括有传统分类法和数值分类法。 ②细菌核酸、蛋白质结构的同源程度进行分类法,称种系分类或自然分类。,2、细菌命名:在分类基础上,给每种细菌一个科学名称,便于交流并保证所有的科研工作者给予同样名称。 3、细菌鉴定:将未知细菌按分类原则,确定细菌的分类地位。,二、细菌的分类地位,1、过去属于植物界,现在划为:原核生物在兽医微生物中,古细菌不占重要地位,古菌,细菌,,,2、细菌还包括 衣原体、立克次氏体、霉形体、螺旋体、放线菌等→对动物和人具有致病作用 蓝细菌、紫色光合细菌等,,,界 Kingdom (拉:Regnum) 门 Phylum (拉:Phylum)) 纲 Class (拉:Classis) 目 Order (拉:Ordo) 科 Family (拉:Familia) 属 Genus(拉:Genus) 种 Species(拉:Species),3、细菌的分类单元 细菌的分类单元与动植物一样,依次为,科及科以上的划分在细菌不太完善,且随着研究的深入科属的划分会发生变动,,1、属(genus)性状相近、关系密切的若干菌种组成一个菌属,与其他属有明显差异。 2、种(species)是细菌学分类的最基本单元,生物学性状基本相同的细菌群体归成一个菌种。 3、菌株(strain)是不同来源的某一种细菌的纯培养物。,三、细菌的命名,1、细菌的命名依据“国际细菌命名法规”(The International Code of Nomenclature of Bacteria) 学名用拉丁文,遵循“双名法”。 每一种细菌的拉丁文名称由属名和种名两部分组成如:产气荚膜梭菌(Clostridium perfringens) 属名在前,字首字母要大写,其余小写 整个属名及种名在出版物中应排成斜体 中文译名,种名在前,属名在后,2、分类学文献中的细菌拉丁文学名,属名和种名之后,往往还要加上首次定名人(加括号)、现名定名人和现名定名年份,这些均用正体排字。 一般兽医学及医学微生物学文献中,属名和种名之后的部分均予省略。 如:Escherichia coli,,例如 大肠埃希菌的学名全名是:Escherichia coli(Migula) Castellani et Chalmers l919指的是Migula于1895年命名此菌为Bacillu coli,Castellani及Chalmers于1919年改为现名。,,金黄色葡萄球菌的学名为:,,3、拉丁文学名应按拉丁文字母的发音规则读念 4、属名重复出现时,拉丁文可缩写,用第一个字母,为避免混肴,也可用2个字母。大肠杆菌(E.coli),5、只确定属名、未确定种名的某一株细菌,其拉丁文学名可在属名之后加sp.(正体字);如果同属未定种名的若干菌株,则用spp. (species 的缩写, sp. 表示单数,spp. 表示复数 ) , 如 Micrococcus sp.表示微球菌属的一个种, Micrococcus spp. 表示微球菌属的一些种。,,6、如果是新种,在新种的拉丁文学名之后还要加上“sp.nov。”,nov是novel的缩写。 例如Lawsonia intracellularis gen.Nov. sp . Nov.,译为:胞内劳森菌,新属新种。,,7、亚种用subsp.(正体字)表示,这是subspecies的缩写, 例如Pasteurella multocida subsp.septica,中译名为多杀性巴氏杆菌败血亚种。,四、细菌分类鉴定的标准,1、长期以来,细菌分类鉴定的主要依据是其表型(phenotype)特征,这些表型特征对细菌的鉴定和分类具有很重要的作用,尤其是在临床微生物学的实中,至今仍有应用价值。,,形态 染色 培养 细胞壁结构 生理生化 抗原特性,2、目前微生物学界普遍考虑的分类依据是细菌的种系发生关系(phylogenetic relationship),即分析其基因特征从而确定分类地位。 研究细菌的种系发生关系主要采用三种方法: 1)测定DNA碱基(G+C)mol% 2)核酸分子杂交 3)16SrRNA寡核苷酸编目,1)DNA碱基G+C%比例的测定,亲缘关系相近的种GC比也相近,GC比
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